本ページでは、日本メダカ協会新品種認定制度によって【新しい改良メダカ】として新品種認定されてメダカを紹介します。
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2013～2021年（旧制度）
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- 第一号 はにぽん
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- 第二号 瞳
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- 第三号 流星
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- 第四号 雪舟
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- 第五号 星河
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- 第六号 鮮虹
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- 第七号 白ラメ幹之ヒカリ
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- 第八号 白ラメ幹之体内光
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- 第九号 ビッグアイ水泡眼
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- 第十号 アルビノシースルー出目
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- 第十一号 星
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- 第十二号 幹之体内光錦
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- 第十三号 勾玉
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- 第十四号 夜空蛍
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- 第十五号 颯太
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- 第十六号 愛心
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- 第十七号 豊光
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- 第十八号 深海
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- 第十九号 風神
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- 第二十号 五郎丸
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- 第二十一号 雷神
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- 第二十二号 美桜
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- 第二十三号 謙信
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- 第二十四号 福星
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- 第二十五号 ビッグアイ星河
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- 第二十六号 未来
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- 第二十七号 ヒレ長ビッグアイ体外光
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- 第二十八号 ブラックビッグアイ
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- 第二十九号 霞
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- 第三十号 福星光
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- 第三十一号 シルキー新体型
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- 第三十二号 蝶蘭
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- 第三十三号 清流きりゅう
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- 第三十四号 体外光腹一周光光
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- 第三十五号 スモールアイスワロー
2021年以降（現制度）
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2013～2021年（旧制度）
| 番号 | ニックネーム | 読み方 | 旧 品種名（参考） | 作出年 | 作出者 |
| 1 | はにぽん | はにぽん | プラックパンダメダカ | 2013 | 清水昭紀 |
| 2 | 瞳 | ひとみ | アルビノパンダブドウ眼 | 2013 | 福永恵 |
| 3 | 流星 | りゅうせい | 背ビレ無し幹之メダカ | 2013 | 中里良則 |
| 4 | 雪舟 | せっしゅう | 幹之錦メダカ | 2013 | 寺井道典 |
| 5 | 星河 | せいが | 青ラメ幹之メダカ | 2012 | 和田敏拓 |
| 6 | 鮮虹 | せんこう | 青ラメ幹之メダカ | 2012 | 廣江邦昭 |
| 7 | 白ラメ幹之ヒカリ | しろらめみゆきひかり | 白ラメ幹之ヒカリ体型 | 2013 | 和田敏拓 |
| 8 | 白ラメ幹之体内光 | しろらめみゆきたいないこう | 白ラメ幹之体内光 | 2013 | 和田敏拓 |
| 9 | 青ビッグアイ水泡眼 | あおびっぐあいすいほうがん | ビックアイ水泡眼 | 2015 | 仁井谷努 |
| 10 | 白アルビノ出目シースルー | しろでめあるびのでめしーするー | アルビノシースルー出目 | 2015 | 水津徹 |
| 11 | 星 | きらり | 青ラメ幹之体内光 | 2015 | 竹岡広文 |
| 12 | 幹之体内光錦 | みゆきたいないこうにしき | 幹之体内光錦 | 2015 | 和田敏拓 |
| 13 | 勾玉 | まがたま | 背ビレ無しアルビノメダカ | 2015 | 清水昭紀 |
| 14 | 夜空蛍 | やくうぼたる | 黒３色ラメ | 2015 | 廣江邦昭 |
| 15 | 颯太 | そうた | 琥珀透明鱗新体型 | 2015 | 今村武徳 |
| 16 | 愛心 | あいみ | アルビノ透明鱗新体型 | 2015 | 今村武徳 |
| 17 | 豊光 | とよひかり | 背ビレ無し白幹之体内光 | 2015 | 永井豊 |
| 18 | 深海 | しんかい | 体内ブルー体外光なし | 2010 | 長岡龍聖 |
| 19 | 風神 | ふうじん | 白メラー | 2012 | 大場幸雄 |
| 20 | 五郎丸 | ごろうまる | 青パンダ目前 | 2016 | 西澤良一 |
| 21 | 雷神 | らいじん | 黄メラー | 2012 | 松本陵汰 |
| 22 | 美桜 | みお | 目前ピンク | 2016 | 大場幸雄 |
| 23 | 謙信 | けんしん | ブラックヒカリスワロー | 2016 | 大場幸雄 |
| 24 | 福星 | ふくせい | アルビノラメ | 2016 | 福永恵 |
| 25 | ビッグアイ星河 | びっぐあいせいが | ビッグアイ青ラメ幹之 | 2016 | 仁井谷啓隆 |
| 26 | 未来 | みらい | 三色光黄金ラメ | 2016 | 齋藤士郎 |
| 27 | 青ビッグアイ幹之ヒレ長 | あおびっぐあいみゆきひれなが | ヒレ長ビッグアイ体外光 | 2017 | 仁井谷啓隆 |
| 28 | ブラックビッグアイ | ぶらっくびっぐあい | ブラックビッグアイ | 2017 | 仁井谷啓隆 |
| 29 | 霞 | かすみ | アルビノ体外光ヒレ長 | 2018 | 阿部正治 |
| 30 | 福星光 | ふくせいひかり | アルビノヒカリラメ | 2018 | 福永恵 |
| 31 | シルキー新体型 | しるきーしんたいけい | シルキー新体型 | 2018 | 齋藤優作 |
| 32 | 蝶蘭 | ちょうらん | ヒレ長ラメヒカリ | 2018 | 佐々木圭 |
| 33 | 清流きりゅう | せいりゅうきりゅう | 体外光横腹光 | 2018 | 高草木二三男 |
| 34 | 清流きりゅう体外光ヒカリ | せいりゅうきりゅうたいがいこうひかり | 体外光横一周光ヒカリ | 2018 | 高草木二三男 |
| 35 | 青スモールアイスワロー | あおすもーるあいすわろー | スモールアイスワロー | 2018 | 大場幸雄 |
2021年以降の認定新品種（現制度）
| 番号 | ニックネーム | 読み方 | 新品種名 | 形質補足 | 共通補足 | 作出年 | 作出者 |
| 36 | 北辻ヒレロング | きたつじひれろんぐ | 2021 | 山本健二 | |||
| 37 | もも | もも | 白朱赤ラメ斑ヒレ長 | 2022 | 大場貴保 | ||
| 38 | 燕 | ツバクロ | ブラックスワローリアルロングフィンヒカリ | 背地反応なし | 2023 | 箱崎 嵩 | |
| 39 | kimera | キメラ | 黄アルビノパンダアースアイ | アルビノ（チェンジカラー）、アースアイ（青） | シースルー、モザイクパンダ | 2024 | 小野澤 一輝 |
| 40 | デビル | デビル | フラックアースアイラメスワローロングフィン | 背地反応なし、ヒレ光 | 2024 | 箱崎 嵩 |